Το Τμήμα διοργανώνει από το 2012-2013 Μεταπτυχιακά Προγράμματα Σπουδών, τα οποία καλύπτουν σύγχρονα ζητήματα και ανταποκρίνονται πλήρως στην ανάγκη απόκτησης νέων γνώσεων και δεξιοτήτων. Το Τμήμα έχει αποκτήσει εξαιρετική εμπειρία στον τομέα αυτό, βελτιώνει διαρκώς την ποιότητα των σπουδών με νέα μαθήματα, υψηλού επιπέδου διδακτικό προσωπικό και νέες συνεργασίες με Τμήματα και Πανεπιστήμια του εξωτερικού και της Ελλάδας.

Το ΠΜΣ Διακυβέρνηση και Δημόσιες Πολιτικές και το  ΔΔΠΜΣ Τοπική και Περιφερειακή Ανάπτυξη και Αυτοδιοίκηση πιστοποιήθηκαν στις 17 Ιουνίου 2026 από την Εθνική Αρχή Ανώτατης Εκπαίδευσης (ΕΘΑΑΕ), με πλήρη συμμόρφωσή τους με τις αρχές του Προτύπου Ποιότητας για την Πιστοποίηση των Προγραμμάτων Μεταπτυχιακών Σπουδών  της ΕΘΑΑΕ και τις Αρχές και Κατευθυντήριες Οδηγίες για τη Διασφάλιση Ποιότητας στον Ευρωπαϊκό Χώρο Ανώτατης Εκπαίδευσης (ESG), για το επίπεδο σπουδών 7 του Εθνικού και Ευρωπαϊκού Πλαισίου Προσόντων. Η πιστοποίηση έχει πενταετή διάρκεια, έως τις 16 Ιουνίου 2031.